刺客信条：兄弟会

紧接着《刺客信条II》，酒保戴斯蒙德迈尔斯和另外三个现代刺客，肖恩黑斯廷斯的露西斯蒂尔曼和丽贝卡科雷尔，逃离了圣殿骑士的追捕，来到了意大利城市蒙特里。

将奥迪托雷庄园废弃的地下室作为新的藏身之处，德斯蒙德再次使用了基因记忆追踪机器“阿尼姆斯”

2.0”，再次进入了他的刺客祖先埃齐奥奥迪托雷(佛罗伦萨的埃齐奥奥迪托雷)的记忆。

1499年12月，文艺复兴时期，40岁的塞尔吉奥在放弃对教皇亚历山大六世罗德里戈波齐亚(圣殿骑士团团长)的暗杀后回到蒙特利。1500年1月，教皇的儿子Cizel Borgia在一天晚上领导了对这座城市的攻击。

破城之时，西泽尔夺回了由艾齐奥的叔叔马里奥奥迪托雷保管的古代遗物“伊甸园的碎片——金苹果”，将其射杀，并命令士兵射杀艾齐奥。艾齐奥受伤后带领雇佣兵及其家属逃跑，独自前往意大利首都罗马。

还发现波吉亚家族几乎已经完全控制了整个罗马城，市区各行各业萧条，市民被剥削，生活贫困。《艾奇奥》以城市中台伯河畔的岛屿伊索拉提贝里纳(Isola Tiberina)为背景，将城市中的妓女、小偷和雇佣兵联系在一起。

招募反叛的公民加入他们的刺客兄弟会来解放教皇控制下的罗马。在各方的帮助下，Aizio得知Cizel的财务由哥哥Juan Boccia负责。

西泽尔想要在法国路易十二、瓦卢瓦公爵和发明家达芬奇的战争机器的帮助下征服意大利。

在瓦解了西泽尔的财力和军队，摧毁了达芬奇制造的战争机器后，埃齐奥于1503年潜入了梵蒂冈的圣天使城堡。当我想与教皇对抗时，我得知伊甸园的碎片已经落入教皇手中。

教皇毒死了西泽尔，因为他不满儿子无止境的野心，包括进攻蒙特雷。西泽尔知道后，用有毒的苹果杀死了教皇，并去圣彼得大教堂从伊甸园取回金苹果，但埃齐奥先拿到了。同年12月，教皇朱利叶斯二世登基，下令逮捕西泽尔。

1507年3月，艾齐奥前往西班牙的维安纳，在围城中与西泽尔进行了最后的决斗。打败西泽尔后，艾齐奥把他从城墙上扔了出去，最后把金苹果藏在了罗马斗兽场的一个密室里。

德斯蒙德等4人在查出密室密码后前往正在建设中的斗兽场，通过地下通道进入天坛圣母院大教堂。启动了教堂的内脏后，德斯蒙德四人成功进入了教堂下的朱诺坦普尔(伊甸园碎片所在的地方)。

然而，当德斯蒙德拿起伊甸园的碎片时，被称为朱诺(属于古代“第一文明”种族)的立体形象控制了他的身体，刺向露西的腹部，游戏的主要情节结束。